Die Bibliothek des Melanchthonhauses ist eine wissenschaftliche Spezialbibliothek, die der Erforschung der Reformation und des Humanismus und vor allem der Erforschung des geistigen und kulturellen Erbes Melanchthons dient.

Die Bibliothek umfasst ca. 13.000 Medieneinheiten. Ein großer Teil der Bibliothek ist der historische Bestand mit über viertausend Drucken aus der und über die Reformationszeit. Alleine aus dem 16. Jahrhundert sind es 2.200 Drucke, die Hälfte davon sind Melanchthon-Drucke.

Die Bestände der Bibliothek können über das Bibliotheksportal Karlsruhe recherchiert werden.